BGK ocenia wnioski w kilku etapach: weryfikacja formalna, ocena merytoryczna i ranking. Kredyt ekologiczny jest przyznawany po szczegółowej analizie. Z analizy dotychczasowych naborów wynika, że od złożenia wniosku do podpisania umowy o dofinansowanie mija zwykle 4-6 miesięcy. Ostateczny termin zależy od liczby wniosków i ewentualnych wezwań do uzupełnień.